36協定の範囲内での残業が認められていました。有休は期ごとに取得の計画を提出するのですが、それ以外のタイミングでも申請すれば基本的に承認されるので、普段からきっちり仕事をしていれば、わりと自由に休暇を取ることができていました。
残業をする際は、協定に基づいた範囲内で残業をするのですが、管理者の承認が必要です。ですが、部署や管理者により、残業がつけられずにサービス残業を強いられることがあります。経営層がそういったところまで気をまわしてくれれば仕事がしやすくなると思います。